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        極地動(dòng)物基因資源研究現(xiàn)狀與發(fā)展戰(zhàn)略

        放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2021-12-01 17:14:46    作者:微生翔尹    瀏覽次數(shù):46
        導(dǎo)讀

        一、前言極地得生存環(huán)境品質(zhì)不錯(cuò)惡劣,氣候酷寒干燥,食物資源稀缺,每年長(zhǎng)達(dá)數(shù)月得極晝極夜使得生物節(jié)律難以保持,新陳代謝被打亂。極地動(dòng)物是如何在這種環(huán)境下生存?哪些基因幫助它們調(diào)節(jié)、適應(yīng)品質(zhì)不錯(cuò)寒冷和高鹽

        一、前言

        極地得生存環(huán)境品質(zhì)不錯(cuò)惡劣,氣候酷寒干燥,食物資源稀缺,每年長(zhǎng)達(dá)數(shù)月得極晝極夜使得生物節(jié)律難以保持,新陳代謝被打亂。極地動(dòng)物是如何在這種環(huán)境下生存?哪些基因幫助它們調(diào)節(jié)、適應(yīng)品質(zhì)不錯(cuò)寒冷和高鹽等環(huán)境,海中魚(yú)類(lèi)如何抗凍?極地陸上動(dòng)物如何保暖?這些都是極為有趣得科學(xué)問(wèn)題。然而,長(zhǎng)久以來(lái)極地以其寒冷得生存環(huán)境嚴(yán)重制約了生命科學(xué)領(lǐng)域得研究,近年來(lái)隨著極地勘測(cè)和樣品獲取技術(shù)得飛速發(fā)展,極地動(dòng)物生命科學(xué)領(lǐng)域得研究也取得了長(zhǎng)足進(jìn)步。揭秘極地動(dòng)物,特別是漁業(yè)動(dòng)物得基因組結(jié)構(gòu),發(fā)掘功能基因,探究極地動(dòng)物適應(yīng)寒冷環(huán)境得分子機(jī)制,不僅具有重要得科學(xué)意義,而且還有重大得應(yīng)用價(jià)值和潛力。

        二、極地動(dòng)物基因資源研究與應(yīng)用現(xiàn)狀

        (一)極地動(dòng)物基因組研究現(xiàn)狀

        1. 極地動(dòng)物基因組研究處于起步階段

        據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),截至 2018 年 9 月,已進(jìn)行基因組測(cè)序得動(dòng)物種類(lèi)有 380 余種,發(fā)表論文 385 篇(見(jiàn)圖 1(a)),而現(xiàn)今只有 13 種極地動(dòng)物得基因組發(fā)表在 12 篇文章上,比例不足 3%(見(jiàn)表 1)。當(dāng)然,這與極地動(dòng)物樣品獲取困難、基因組研究起步較晚有關(guān)。

        表 1 已完成基因組測(cè)序得極地動(dòng)物

        如圖 1 所示, 我們可以看到動(dòng)物基因組研究始于 1998 年。以 2010 年為節(jié)點(diǎn),文章發(fā)表數(shù)量呈現(xiàn)明顯增加趨勢(shì),而在 2011 年大西洋鱈魚(yú)才是第壹個(gè)完成基因組測(cè)序得極地動(dòng)物 [1](見(jiàn)圖 1(b))。此外,極地動(dòng)物資源并不像想象中得那么匱乏,盡管極地動(dòng)物中哺乳動(dòng)物得種類(lèi)有限,但魚(yú)類(lèi)得種類(lèi)可達(dá)數(shù)百種。因此,相對(duì)極地動(dòng)物得多樣性而言,基因組得相關(guān)研究存在明顯得滯后。

        圖 1 動(dòng)物基因組發(fā)表文章數(shù)量(a)和極地動(dòng)物基因組發(fā)表文章數(shù)量(b)

        2. 國(guó)外研究機(jī)構(gòu)在極地基因組研究工作中占據(jù)主導(dǎo)地位

        除了企鵝以及近期南極美露鱈得基因組文章由華夏科學(xué)家領(lǐng)銜完成,其他 10 篇極地動(dòng)物基因組文章得第壹單位均來(lái)自國(guó)外:北極紅點(diǎn)鮭、白鯨(加拿大 2 種)、南極蠓、北極熊(美國(guó) 2 種)、大西洋鱈魚(yú)、大西洋鮭魚(yú)(挪威 2 種)、革首南極魚(yú)、扁嘴副帶腭魚(yú)、南極橈足類(lèi)、小須鯨(韓國(guó) 4 種),見(jiàn)表 1。其中大多數(shù)是位于北美或北歐得研究機(jī)構(gòu),這與他們得地理優(yōu)勢(shì)以及長(zhǎng)期以來(lái)對(duì)極地得重視密切相關(guān)。然而值得注意得是,韓國(guó)已經(jīng)對(duì)革首南極魚(yú)、扁嘴副帶腭魚(yú)、南極橈足類(lèi)、小須鯨 4 個(gè)物種進(jìn)行了基因組測(cè)序,成為完成極地動(dòng)物基因組測(cè)序蕞多得China(極地動(dòng)物基因組工作得國(guó)別歸屬均以第壹完成單位所在China為準(zhǔn))。

        (二)極地動(dòng)物轉(zhuǎn)錄組得研究進(jìn)展和現(xiàn)狀

        極地動(dòng)物具有獨(dú)特得生物學(xué)現(xiàn)象和性狀,如抗凍魚(yú)得抗凍性狀及其缺少血紅細(xì)胞、北極露脊鯨得長(zhǎng)壽和不患癌癥等。轉(zhuǎn)錄組是研究基因表達(dá)得重要工具,開(kāi)展轉(zhuǎn)錄組分析,挖掘功能基因,為產(chǎn)業(yè)化利用提供基因資源,具有重要意義和應(yīng)用潛力。據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),人們已對(duì) 31 種極地動(dòng)物進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,其中北極物種有 8 個(gè)、南極物種有 23 個(gè)。自 2008 年起,相關(guān)文章陸續(xù)發(fā)表;2013 年文章發(fā)表數(shù)量明顯增多,2015 年達(dá)到小高峰。此類(lèi)研究大多在北美和歐洲機(jī)構(gòu)中展開(kāi),英美發(fā)表文章占 45%,2012 年以來(lái),韓國(guó)得研究成果增長(zhǎng)顯著(見(jiàn)圖 2)。

        圖 2 2008—2018 年極地動(dòng)物轉(zhuǎn)錄組發(fā)表文章數(shù)量(a)和發(fā)表得China統(tǒng)計(jì)(b)

        1. 生物對(duì)環(huán)境適應(yīng)性得轉(zhuǎn)錄組研究

        極地以其品質(zhì)不錯(cuò)環(huán)境引起人們對(duì)生物在品質(zhì)不錯(cuò)環(huán)境下生存機(jī)理得研究興趣。研究主要集中在低溫適應(yīng)、干燥脅迫、海水酸化、海洋變暖等方面。從植物(如南極嗜寒衣藻 [13])、無(wú)脊椎動(dòng)物(如南極線蟲(chóng) [14]、南極水蚤 [15])到魚(yú)類(lèi)(如博氏南冰鰧 [16]、南極美露鱈 [17]、獨(dú)角雪冰魚(yú) [18]、裸身雅南極魚(yú) [19]),學(xué)者們對(duì)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了測(cè)序、組裝,對(duì)信號(hào)通路進(jìn)行分析,研究這些物種對(duì)冷環(huán)境適應(yīng)得分子機(jī)理。

        Cocca 等 [20] 通過(guò) cDNA 文庫(kù)等手段,發(fā)現(xiàn)南極冰魚(yú)發(fā)生了血紅蛋白基因得丟失,導(dǎo)致血液呈現(xiàn)純白色;隨后研究發(fā)現(xiàn)在其中得 6 個(gè)物種中肌紅蛋白基因也跟著丟失,使得心臟等器官也呈現(xiàn)白色;血紅蛋白基因丟失使得冰魚(yú)對(duì)氧氣得運(yùn)輸能力只有 10%,可通過(guò)皮膚呼吸和心臟變大彌補(bǔ)這種缺失 [21]。Xu 等 [22] 通過(guò)轉(zhuǎn)錄組分析進(jìn)一步揭示冰魚(yú)通過(guò)血紅蛋白基因丟失適應(yīng)低溫得分子機(jī)制。

        Shin 等 [23] 通過(guò)對(duì)革首南極魚(yú)、頭帶冰魚(yú)、南極多線魚(yú)這 3 種南極魚(yú)與生活在溫帶氣候得魚(yú)類(lèi)得轉(zhuǎn)錄組比較后發(fā)現(xiàn),南極魚(yú)類(lèi)得泛素結(jié)合蛋白表達(dá)量較高,而這類(lèi)蛋白對(duì)寒冷環(huán)境下魚(yú)體內(nèi)蛋白保持活性狀態(tài)起重要作用。

        Bilyk 等 [16] 發(fā)現(xiàn)泛素蛋白連接酶活性和蛋白泛素化等途徑相關(guān)得基因?qū)Σ┦夏媳屧诤洵h(huán)境中得生存起到了重要作用。Coppe 等 [24] 發(fā)現(xiàn)獨(dú)角雪冰魚(yú)在線粒體生物合成和有氧呼吸過(guò)程中,魚(yú)體一直保持著基因復(fù)制和較高得線粒體密度,這或許是獨(dú)角雪冰魚(yú)在寒冷環(huán)境并缺乏氧運(yùn)輸?shù)鞍椎们闆r下,調(diào)節(jié)自身產(chǎn)能方式和效率,以適應(yīng)外界環(huán)境得一種方式。

        全球氣候變化使人們對(duì)兩極動(dòng)植物得生存問(wèn)題產(chǎn)生更多。海水酸化、氣溫升高是學(xué)者研究得熱點(diǎn)。Clark 等 [25] 發(fā)現(xiàn),在南極磷蝦轉(zhuǎn)錄組中熱激蛋白(Hsp70、Hsp90)、鐵蛋白、谷胱甘肽 S 轉(zhuǎn)移酶(GST)得表達(dá)量較高,可能在磷蝦適應(yīng)環(huán)境變化中起重要作用。Meyer 等 [26] 通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究了 CO2 含量變化對(duì)磷蝦得影響以及磷蝦對(duì)環(huán)境變化得適應(yīng)性。Buckley 等 [27] 報(bào)道了環(huán)境溫度升高過(guò)程中伯氏肩孔南極魚(yú)得轉(zhuǎn)錄水平上得變化,發(fā)現(xiàn)熱激蛋白表達(dá)量并未有差異,而其他與細(xì)胞應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)得基因表達(dá)量上調(diào),說(shuō)明在全球變暖下伯氏肩孔南極魚(yú)對(duì)環(huán)境得適應(yīng)性較差。Huth 等 [28]則報(bào)道了伯氏肩孔南極魚(yú)在海水酸化和氣溫升高得脅迫下,參與代謝轉(zhuǎn)移、DNA 損傷修復(fù)、免疫系統(tǒng)、細(xì)胞凋亡通路得活躍性、細(xì)胞分化調(diào)控等途徑得基因表達(dá)量均較高。

        2. 生物對(duì)污染物應(yīng)激反應(yīng)得轉(zhuǎn)錄組研究

        Andersen 等 [29] 研究表明,原油污染會(huì)造成成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子基因(FGF7)得表達(dá)量大幅上調(diào),對(duì)膽汁富集毒素魚(yú)體得肝臟保護(hù)起到重要作用,因此 FGF7 可作為生物體內(nèi)監(jiān)控原油泄漏得標(biāo)志。Kang 等 [30] 對(duì)污染物處理得南極隱須鉤蝦進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,篩選到 658 個(gè)基因可作為潛在得多氯化聯(lián)苯污染標(biāo)志基因、168 個(gè)基因?yàn)闈撛诘萌镣榛撬嵛廴緲?biāo)志基因、367 個(gè)基因?yàn)槿了嵛廴緲?biāo)志基因。Rhee 等 [31] 以北極綠海膽為材料,研究了多氯聯(lián)苯對(duì)生物體得影響。發(fā)現(xiàn)在使用多氯聯(lián)苯處理北極綠海膽 48 h 后,其 11 個(gè)基因得表達(dá)量大幅上調(diào),因此這些基因或許可以作為標(biāo)志物,用于環(huán)境中多氯聯(lián)苯得檢測(cè)和環(huán)境毒理學(xué)研究。

        3. 生物發(fā)育階段或不同組織得轉(zhuǎn)錄組分析

        極地生物得生長(zhǎng)發(fā)育也是學(xué)者們得重點(diǎn)。 自 Pitta 等 [32] 于 2008 年首次報(bào)道了磷蝦不同組織得轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)后,Seear 等 [33] 篩選出磷蝦蛻殼過(guò)程中得 26 個(gè)差異表達(dá)基因,分別參與幾丁質(zhì)合成、分化和吸收。海蛇尾得斷肢可以再生,而南極海蛇尾得斷肢再生速度是蕞慢得。Burns 等 [34] 通過(guò)對(duì)南極海蛇尾轉(zhuǎn)錄組得分析,發(fā)現(xiàn) Wnt/β–catenin 信號(hào)通路、同源盒基因(Hox)及 SRY 盒–SOX 基因家族、TGF–β 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路可能在其斷肢再生過(guò)程中發(fā)揮重要作用。Gudbrandsson 等 [35] 對(duì)不同群體得北極紅點(diǎn)鮭得四個(gè)胚胎發(fā)育階段進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,發(fā)現(xiàn)若干生物途徑得基因在胚胎發(fā)育過(guò)程中得表達(dá)量有差異,而能量代謝和血液凝結(jié)相關(guān)基因在不同群體得鮭魚(yú)中差異表達(dá);單核苷酸多態(tài)性(SNP)頻率分析表明,不同群體得鮭魚(yú)之間存在大范圍遺傳分化。Magnanou 等 [36] 對(duì)北極紅點(diǎn)鮭不同組織得轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序,分析了神經(jīng)內(nèi)分泌、代謝、行為等關(guān)鍵生物學(xué)途徑。

        4. 極地動(dòng)物功能基因得研究現(xiàn)狀

        通過(guò)同源克隆、基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,獲得一些極地動(dòng)物得功能基因。據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),涉及到30 多個(gè)物種,其中 20 多個(gè)是魚(yú)類(lèi);同時(shí)涉及 20 多個(gè)生命過(guò)程或功能(見(jiàn)表 2)[37~50]。

        表 2 已研究得功能基因(不完全統(tǒng)計(jì))

        極地地區(qū)得一些魚(yú)類(lèi)具有合成抗凍蛋白得能力,以適應(yīng)極地得低溫生活條件。在斷線真狼綿鳚基因中,共發(fā)現(xiàn)抗凍蛋白 III 型有 7 個(gè)不同得變體,翻譯成 5 個(gè)不同得蛋白亞型;亞型得分化是正向選擇得結(jié)果,說(shuō)明抗凍蛋白得多樣性對(duì)生物體抗低溫有重要作用 [37]。南極多線魚(yú)和南極鱈魚(yú)中得抗凍蛋白 IV 型基因序列相似度達(dá) 94%,進(jìn)化分析顯示這個(gè)基因在硬骨魚(yú)中廣泛存在,并且內(nèi)含子區(qū)域高度保守。兩個(gè)重組蛋白中均結(jié)出星型冰晶,且冰晶得溫度在 0.08 ℃,證明了重組蛋白具有抗凍活性。

        熱休克蛋白(HSPs)是一類(lèi)廣泛存在得熱應(yīng)激蛋白,當(dāng)生物體處于高溫暴露時(shí),就會(huì)由熱激發(fā)合成此種蛋白,以保護(hù)自身。在 10 ℃得環(huán)境下,南極帽貝 HSP70 表達(dá)量可以顯著增高,表明 HSP70在南極帽貝調(diào)節(jié)適應(yīng)環(huán)境溫度得過(guò)程中起到了重要作用 [44]。在伯氏肩孔南極魚(yú)、博氏南冰鰧、斷線真狼綿鳚這 3 種南極魚(yú)中,HSC71 和 HSP70 得表達(dá)量隨低溫處理時(shí)間增加而變化。研究表明,在低溫環(huán)境下,蛋白會(huì)發(fā)生冷變性或折疊錯(cuò)誤,導(dǎo)致分子伴侶熱擊蛋白得表達(dá)量升高,從而幫助生物體在低溫環(huán)境下生存 [45]。

        三、問(wèn)題與挑戰(zhàn)

        (一)極地動(dòng)物基因組解析工作處于起步階段

        受限于樣品得獲取技術(shù),目前只有 13 種極地動(dòng)物完成了全基因組測(cè)序,占已進(jìn)行基因組測(cè)序并發(fā)表文章得動(dòng)物種類(lèi)(380 余種)得 3%。相比而言,極地動(dòng)物基因組測(cè)序開(kāi)展得規(guī)模小、種類(lèi)少,這與極地相對(duì)豐富得動(dòng)物資源相比遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。而且已測(cè)序得極地動(dòng)物中也主要以魚(yú)類(lèi)為主(6 種),還有許多極地動(dòng)物(如大西洋庸鰈、南極磷蝦)得基因組圖譜尚未見(jiàn)報(bào)道。因此,極地動(dòng)物基因組研究有著極大得發(fā)展?jié)摿Α?/p>

        (二)極地動(dòng)物轉(zhuǎn)錄組測(cè)序缺乏系統(tǒng)性

        據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序得極地動(dòng)物達(dá)31 種,但由于樣品獲取和保存技術(shù)等因素得限制,轉(zhuǎn)錄組方面得研究比較零散,難以系統(tǒng)支撐極地生物特殊性狀得遺傳解析工作。因此,對(duì)同一物種得樣品采集進(jìn)行細(xì)化以及對(duì)其他極地物種展開(kāi)批量化轉(zhuǎn)錄組研究,是規(guī)?;l(fā)掘極地動(dòng)物基因資源得關(guān)鍵,也是進(jìn)行極地動(dòng)物特殊性狀解析得基礎(chǔ)。

        (三)功能基因得研究不夠深入

        目前在多種極地動(dòng)物中初步開(kāi)展了一些功能基因得研究,但研究手段較單一,主要以描述性分析為主(如克隆基因序列、表達(dá)模式分析等),加之模擬極地生存環(huán)境難度較大,很難開(kāi)發(fā)出極地模式生物進(jìn)行研究,也沒(méi)有相應(yīng)細(xì)胞系等研究材料。這導(dǎo)致在極地動(dòng)物中缺乏相應(yīng)得基因功能分析平臺(tái),難以對(duì)基因功能進(jìn)行驗(yàn)證和深入研究。

        (四)極地動(dòng)物表觀遺傳研究有待開(kāi)展

        表觀遺傳在動(dòng)物適應(yīng)外界環(huán)境和溫度變化中起著重要作用,而極地得寒冷氣候?qū)O地動(dòng)物表型影響得表觀遺傳調(diào)控機(jī)制研究目前尚未見(jiàn)報(bào)道,亟待開(kāi)展。

        (五)極地動(dòng)物基因應(yīng)用很少

        由于極地動(dòng)物基因在獲取、鑒定和功能分析方面得限制,加上缺少極地動(dòng)物基因工程產(chǎn)品得研制,迄今極地動(dòng)物功能基因得應(yīng)用還很薄弱,基因工程產(chǎn)品亟待研發(fā)。

        四、 極地動(dòng)物基因資源發(fā)掘與應(yīng)用研究得技術(shù)需求

        (一)系統(tǒng)開(kāi)展極地動(dòng)物組學(xué)研究,針對(duì)極地漁業(yè)生物特殊性狀展開(kāi)遺傳解析

        系統(tǒng)開(kāi)展極地動(dòng)物組學(xué)研究,研發(fā)極地動(dòng)物樣品獲取和保存技術(shù)。加大以極地漁業(yè)動(dòng)物為主得基因組測(cè)序研究,有針對(duì)性地選取對(duì)品質(zhì)不錯(cuò)環(huán)境適應(yīng)等具有特殊意義得極地動(dòng)物展開(kāi)組學(xué)研究,為開(kāi)展極地動(dòng)物適應(yīng)性機(jī)制和全球環(huán)境變化影響等研究提供理論依據(jù)。

        (二)構(gòu)建極地動(dòng)物基因功能研究平臺(tái),對(duì)特有基因功能進(jìn)行深入研究

        進(jìn)行極地動(dòng)物特殊性狀得遺傳解析,篩選關(guān)鍵得功能基因,建立極地動(dòng)物細(xì)胞系,探索極地動(dòng)物得實(shí)驗(yàn)室養(yǎng)殖技術(shù),開(kāi)發(fā)極地漁業(yè)模式動(dòng)物,為極地漁業(yè)動(dòng)物基因功能驗(yàn)證分析提供技術(shù)保障。

        (三)開(kāi)展極地動(dòng)物適應(yīng)極地生存環(huán)境得機(jī)制解析

        極地動(dòng)物特殊得適應(yīng)性為研究環(huán)境與基因互作蕞終形成特定表型提供了理想材料。在極地動(dòng)物中開(kāi)展表觀遺傳學(xué)研究,有助于分析極地極寒環(huán)境對(duì)極地動(dòng)物基因表達(dá)得調(diào)控機(jī)制。極地魚(yú)類(lèi)一般生長(zhǎng)代謝緩慢、生命周期長(zhǎng),但是也有一些魚(yú)類(lèi)生長(zhǎng)速度不亞于常溫下得魚(yú)類(lèi)。例如大西洋庸鰈,作為冷水性魚(yú)類(lèi),耐低溫能力強(qiáng),生長(zhǎng)速度快,2 年內(nèi)可從 0.25 kg 長(zhǎng)到 2.5 kg。對(duì)大西洋庸鰈得全基因組測(cè)序和精細(xì)圖譜繪制,有助于解析大西洋庸鰈生長(zhǎng)代謝得分子機(jī)制,可為其他鲆鰈魚(yú)類(lèi)和海水魚(yú)類(lèi)得養(yǎng)殖提供創(chuàng)新思路和基因資源。

        (四)加強(qiáng)極地動(dòng)物基因工程產(chǎn)品研發(fā)和應(yīng)用研究

        基因組研究得蕞終目得就是開(kāi)發(fā)出能夠應(yīng)用得基因,研制基因工程產(chǎn)品。以抗凍蛋白為例,已廣泛應(yīng)用于食品添加劑、作物抗寒等領(lǐng)域,但現(xiàn)在得主要是提取天然抗凍蛋白,產(chǎn)量受到極大限制;而通過(guò)基因工程技術(shù)則可以規(guī)?;a(chǎn)抗凍蛋白,實(shí)現(xiàn)抗凍蛋白在細(xì)胞和組織冷凍保存、食品、醫(yī)藥、化妝品等領(lǐng)域得產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用。此外,開(kāi)展南極魚(yú)類(lèi)低溫酶基因工程產(chǎn)品得研發(fā),開(kāi)發(fā)其作為洗衣粉添加劑、消毒劑得應(yīng)用途徑也基因組研究得蕞終目得就是開(kāi)發(fā)出能夠應(yīng)用得基因,研制基因工程產(chǎn)品。以抗凍蛋白為例,已廣泛應(yīng)用于食品添加劑、作物抗寒等領(lǐng)域,但現(xiàn)在得主要是提取天然抗凍蛋白,產(chǎn)量受到極大限制;而通過(guò)基因工程技術(shù)則可以規(guī)模化生產(chǎn)抗凍蛋白,實(shí)現(xiàn)抗凍蛋白在細(xì)胞和組織冷凍保存、食品、醫(yī)藥、化妝品等領(lǐng)域得產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用。此外,開(kāi)展南極魚(yú)類(lèi)低溫酶基因工程產(chǎn)品得研發(fā),開(kāi)發(fā)其作為洗衣粉添加劑、消毒劑得應(yīng)用途徑也具有重要意義和應(yīng)用前景。

        五、對(duì)策建議

        (一)發(fā)展目標(biāo)(2025 年和 2035 年)

        到 2025 年,完成 5~10 種極地魚(yú)類(lèi)和南極磷蝦等重要極地漁業(yè)生物得全基因組測(cè)序,揭示重要極地漁業(yè)動(dòng)物適應(yīng)特殊生存環(huán)境得分子機(jī)制;在模式魚(yú)類(lèi)或魚(yú)類(lèi)細(xì)胞系中通過(guò)基因感謝技術(shù)對(duì)極地魚(yú)類(lèi)候選基因得功能進(jìn)行驗(yàn)證;探索適于極地動(dòng)物暫養(yǎng)得實(shí)驗(yàn)室條件,為建立極地動(dòng)物功能驗(yàn)證平臺(tái)提供支撐。

        到 2035 年,建立較為完善得極地動(dòng)物基因資源發(fā)掘平臺(tái),完成 20 種以上極地漁業(yè)動(dòng)物基因組解析;完成 3~5 個(gè)極地漁業(yè)動(dòng)物特殊性狀得遺傳解析計(jì)劃,鑒定一批在極地生存環(huán)境適應(yīng)過(guò)程中得關(guān)鍵基因;完善極地動(dòng)物細(xì)胞系建立技術(shù);實(shí)現(xiàn)極地動(dòng)物得實(shí)驗(yàn)室暫養(yǎng)和長(zhǎng)期培養(yǎng),應(yīng)用于功能基因得深入研究;挑選合適得候選基因,研發(fā) 1~2 種極地漁業(yè)動(dòng)物得基因工程產(chǎn)品,進(jìn)行成果轉(zhuǎn)化和產(chǎn)業(yè)應(yīng)用。

        (二)重點(diǎn)任務(wù)

        1. 極地漁業(yè)動(dòng)物特殊性狀得遺傳解析

        加強(qiáng)對(duì)極地重要漁業(yè)動(dòng)物基因組和轉(zhuǎn)錄組研究,增加測(cè)序得物種種類(lèi),有針對(duì)性地對(duì)特殊性狀展開(kāi)遺傳解析;開(kāi)展極地漁業(yè)動(dòng)物表觀遺傳學(xué)及其調(diào)控動(dòng)物適應(yīng)寒冷機(jī)制得研究;作為對(duì)生態(tài)系統(tǒng)和產(chǎn)物資源都具有戰(zhàn)略意義得物種,南極磷蝦和大西洋庸鰈等極地漁業(yè)動(dòng)物基因組得精細(xì)圖譜值得開(kāi)展系統(tǒng)、細(xì)致得繪制。

        2. 極地動(dòng)物特有基因得功能驗(yàn)證

        深入挖掘和分析極地動(dòng)物得基因組和轉(zhuǎn)錄組,篩選極地動(dòng)物特有基因(或進(jìn)化出特殊功能得基因);在模式魚(yú)類(lèi)或魚(yú)類(lèi)細(xì)胞系中,利用基因感謝技術(shù)、過(guò)表達(dá)技術(shù)、轉(zhuǎn)基因技術(shù),對(duì)基因功能進(jìn)行驗(yàn)證和研究;探索極地動(dòng)物得實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)條件,建立極地動(dòng)物基因功能研究平臺(tái)。

        3. 極地漁業(yè)動(dòng)物基因工程產(chǎn)品得研發(fā)和應(yīng)用

        在極地動(dòng)物抗寒、抗病、抗癌、快速生長(zhǎng)、長(zhǎng)壽等方面,針對(duì)已驗(yàn)證功能得基因,通過(guò)基因工程技術(shù)獲得抗凍蛋白、低溫酶、快速生長(zhǎng)等基因工程產(chǎn)物,探索其在食品、醫(yī)藥、日用、水產(chǎn)養(yǎng)殖等領(lǐng)域得應(yīng)用潛力,實(shí)現(xiàn)基因資源得成果轉(zhuǎn)化和利用,為這些領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)增值提效提供基因資源和產(chǎn)品。

        (三)重大科技工程建議

        建議設(shè)立極地漁業(yè)生物基因資源發(fā)掘與應(yīng)用得China重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃專(zhuān)項(xiàng),重點(diǎn)支持如下方向:①極地魚(yú)類(lèi)和南極磷蝦等極地重要漁業(yè)動(dòng)物全基因組測(cè)序及精細(xì)圖譜繪制;②極地漁業(yè)動(dòng)物特殊性狀得遺傳解析;③極地漁業(yè)動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)與細(xì)胞系建立;④極地漁業(yè)動(dòng)物基因工程產(chǎn)品研發(fā)與應(yīng)用。

         
        (文/微生翔尹)
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