第一，水資源利用率較低
新疆屬于干旱地區(qū)，且南北東疆水資源分布不均衡，特別是南疆三地州，長期受到干旱的困擾，新疆農(nóng)業(yè)水利工程建設(shè)較為滯后，水利調(diào)控能力較為低下，且加之水資源滲漏嚴重，最終導致農(nóng)業(yè)用水利用效率較低。
第二，農(nóng)業(yè)交通基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)較為滯后
盡管農(nóng)村公路通達率較高，但村道公路等級差，絕大部分為泥石路，沒有硬化，路面窄，路況差，制約著農(nóng)村經(jīng)濟社會的發(fā)展，也為新農(nóng)村建設(shè)，產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整、人流、物流發(fā)展等帶來了較大不利因素
第三，新疆農(nóng)業(yè)勞動力素質(zhì)偏低
新疆農(nóng)民特別是南疆地區(qū)的農(nóng)民受教育程度存在普遍偏低的狀況，這在一定程度上阻礙了新疆農(nóng)民的勞動輸出，造成農(nóng)民增收只能靠農(nóng)業(yè)發(fā)展的不良后果。
第四，新疆農(nóng)業(yè)科技含量不高，農(nóng)民科技文化素質(zhì)未得到根本提升
第五，新疆農(nóng)業(yè)勞動生產(chǎn)率相對較低。
新疆農(nóng)業(yè)發(fā)展與國外農(nóng)業(yè)發(fā)達省份和內(nèi)地農(nóng)業(yè)發(fā)展良好省份相比，農(nóng)業(yè)勞動生產(chǎn)率差距較大。
第六，新疆農(nóng)產(chǎn)品國際市場參與率較小
隨著新疆與中亞、南亞等周邊國家貿(mào)易的合作與深化，新疆農(nóng)產(chǎn)品出口額也逐年增加，但是農(nóng)業(yè)作為新疆經(jīng)濟的基礎(chǔ)，其主要目標仍是滿足自身需求，即以自給自足為主，新疆農(nóng)產(chǎn)品對外銷售率較低。
第七，資源約束阻礙農(nóng)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展
新疆農(nóng)業(yè)在發(fā)展中出現(xiàn)了諸多問題，如生態(tài)環(huán)境污染、資源緊缺等，逐漸成為阻礙新疆農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的瓶頸。新疆水 土流失嚴重、土地荒漠化加劇，都一定程度的影響了新疆的農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展。
第八，新疆農(nóng)業(yè)抗風險能力較差
這里所說的風險主要有自然風險和市場風險兩類。對于自然風險而言，新疆農(nóng)業(yè)的生產(chǎn)過程對光、土地、水等資源資源的依賴程度較大，而這些自然資源并不總是促進農(nóng)業(yè)發(fā)展與生產(chǎn)，當這些資源產(chǎn)生災(zāi)害時就形成了自然風險。，其農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)受到來自市場需求的影響較大，而市場需求的巨大變化會導致農(nóng)業(yè)生產(chǎn)損失，因此農(nóng)業(yè)生產(chǎn)具有市場風險。新疆農(nóng)業(yè)發(fā)展的市場風險一方面是農(nóng)戶對市場信息的滯后性會導致農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)與市場需求的矛盾，另一方面是即使得到了市場信息，農(nóng)戶還需要擁有對應(yīng)的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)技術(shù)水平
《“絲綢之路經(jīng)濟帶”背景下新疆農(nóng)業(yè)競爭力研究》孫培蕾
